Los objetivos y resultados de la investigación científica e innovación tecnológica de la Universidad Estatal del Sur de Manabí,  se sustentan  en las Políticas de Investigación aprobadas por el H. Consejo Universitario, las que se fundamentan en el principio de pertinencia que trata la Ley Orgánica de Educación Superior; esto es, que la educación superior responda a las expectativas y necesidades de la sociedad, a la planificación nacional, y al régimen de desarrollo, a la prospectiva de desarrollo científico, humanístico y tecnológico mundial, y a la diversidad cultural.

En ese orden, la UNESUM  articulará su oferta de investigación  a las necesidades de desarrollo local, regional y nacional, en base de los principios de sostenibilidad como contribución efectiva al cambio de la matriz productiva, a la sustitución de las importaciones, a la agregación de valor y al mejoramiento de las condiciones de vida de la población proceso que estará encadenado  a las políticas nacionales de ciencia y tecnología, en correspondencia  con las áreas prioritarias de investigación definidas por la SENESCYT.

El rigor científico, la ética, la sinergia, el trabajo multidisciplinario y transdisciplinario,  el respeto a la naturaleza, a las culturas y el  rescate  de los saberes ancestrales, será una práctica permanente de los docentes-investigadores y/o Grupos de investigación de la UNESUM.